Es muy importante que los usuarios conozcan  el uso adecuado del baño seco, Aquí algunas reglas básicas:

Después de cada uso del inodoro, cubrir las heces con el material secante. Las heces deben estar siempre cubiertas con material secante, para ello siempre tendremos un recipiente del material secante al lado del inodoro (wáter) separador. Además, se debe tapar siempre el inodoro para evitar las moscas
Echar un poco de agua en el urinario después de cada uso. El urinario debe estar siempre limpio para evitar malos olores, para ello hay que limpiarlo cuidadosamente evitando el ingreso de agua a la cámara de secado
Los hombres pueden usar el urinario si lo prefieren. Para evitar el riesgo de que ingrese humedad a la cámara de secado la cual debe mantenerse siempre seca.
El papel higienico debe botarse en un tacho. No debe arrojarse papel higienico en la camara de secado debido a que no se descompone rapido.
Mantener siempre limpio el baño seco. El inodoro y el urinario deben limpiarse con frecuencia utilizando una esponja húmeda, con un poco de detergente para evitar el mal olor. El piso del baño debe limpiarse con un trapo húmedo. Al igual que la ducha y el lavadero.