DIVERSIDAD GENÉTICA MOLECULAR DE Mirabilis expansa MEDIANTE RAPD

MOLECULAR GENETIC DIVERSITY OF Mirabilis expansa USING RAPD

 Julio A. Chia W.¹, Cesar F. López B.¹, Raúl Blas S.¹, J. Seminario², R. Mansilla¹ y J. P. Baudoin³

 Resumen

Se estudió la diversidad genética mediante la técnica de RAPD en 37 accesiones de una colección del norte del Perú de “chago” o “mauka” Mirabilis expansa; Se obtuvieron 60 marcadores polimórficos con 9 de 19 iniciadores decaméricos. Se calcularon los índices de iniciador RAPD, obteniéndose los valores más altos con los iniciadores OPA04, OPA09 y OPA13, lo cual sugiere su uso valioso en futuras investigaciones con RAPD en colecciones más grandes o para especies de Mirabilis. Con el coeficiente de Simple Matching y el algoritmo UPGMA se obtuvo un dendograma del cual, a un coeficiente de 1, se observan 31 grupos. Esto indicaría unos 16.216 % de posibles duplicados en la colección de Germoplasma. Con un índice de similitud de 0.85 se encontró que se forman 8 clusters o grupos, sin  coincidir en su mayoría con los 5 morfotipos reportados. Además se realizó un Análisis Molecular de Variancia con 2 componentes: interregional y entre accesiones/ región, cuyos valores fueron 21.69% y 78.3%, respectivamente; valores que sugieren una considerable contribución de variación genética gracias a las muestras de diversas partes del país.

Palabras clave: RAPD, Mirabilis expansa, raíz tuberosa, diversidad genética, AMOVA

Abstract

A collection of 37 accessions of Mirabilis expansa, “chago” or “mauka” from northern Perú, was analyzed by RAPD assays and the molecular genetic diversity determined. In order to know which primer was more informative, the PIC values were summed up and a RAPD primer index calculated, resulting in the primers OPA04, OPA09 y OPA13 with the highest indexes, suggesting their potential utility in further research in Mirabilis species. From 9 of the 19 RAPD primers selected, we obtained 60 polymorphic markers, which yielded a Simple Matching Coefficient Dendogram, which shows 31 groups at a similarity index of 1. It also indicates a 16.216% of possible duplicates in the collection and with a similarity index of 0,85 we observed 8 clusters, with a significant difference compared to the morphological characterization data. An Analysis of Molecular Variance was performed, separating 2 variation components: among regions and among accessions/within region. The values obtained were 21,69% and 78,3% respectively, being both relatively high and showing considerable contribution of genetic variation from samples of diverse collection places.

Key words: RAPD, Mirabilis expansa, Tuber roots, genetic diversity, AMOVA

            Texto completo  

¹Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Agraria La Molina. Apartado postal 12056 Lima 12 - Perú. julio.chiawong@gmail.com / cflb@lamolina.edu.pe
²Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales, Universidad Nacional de Cajamarca.
³Faculté Universitaire des Sciences Agronomiques de Gembloux, Bélgica.
 

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