De acuerdo a las nuevas políticas de investigación para la UNALM, se espera que la investigación se realice de una manera organizada a través de grupos de investigación especializada y multidisciplinarios. La Oficina Académica de Investigación, con el patrocinio del Vicerrectorado Académico, es por el momento (en el futuro será el Vicerrectorado de Investigación) la encargada de coordinar y articular las líneas de investigación de las diferentes facultades, institutos y dependencias internas y externas de la UNALM, con el fin de ofrecer soporte logístico, e infraestructura adecuada, así como realizar procedimientos para la evaluación de los resultados y análisis de la eficacia de la inversión que se realice para fomentar la investigación en la  UNALM.

Una de las estrategias de la Política de Gestión Institucional es definir las líneas prioritarias de investigación, tomando en consideración el Plan Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación, las políticas de desarrollo del estado y las tendencias mundiales, siendo las facultades las que definen las líneas de investigación de su competencia. 

La jefa de la Oficina Académica de Investigación, Dra. Carmen Velezmoro, informó que cada facultad envió previamente sus líneas de investigación, las cuales fueron evaluadas en el taller, desde el punto de vista de cómo esas líneas calzan con lo que el país necesita, tomando en consideración las prioridades que establece el plan bicentenario: Perú hacia el 2021, las líneas prioritarias del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología, además de las establecidas por la Comunidad Europea. “Entre otros aspectos, se busca identificar las necesidades de las acciones de investigación en la universidad para que estas se desarrollen y concreten”  afirmó.