Se localizó 4 marcadores para la acumulación de carotenoides en papa, el grupo de ligamiento para el gen β-caroteno hidroxilasa (BCH) se encuentra localizado en el cromosoma III, el gen Fitoeno sintasa (PSY) y Zeaxantina  epoxidasa (ZEP) se encuentra localizado en el cromosoma II, y finalmente el gen Licopeno β-ciclasa (LYC-B) se encuentra ubicado en el cromosoma IV.

La estructura de la población nos da un K=9, donde alcanza un platou luego de transcurrida mas valoes de K además se halló estructuras familiares dentro de la población siendo importante para posteriores estudios de asociación. 

La caída del DL empieza alrededor de 2cM y se extiende hasta 16 cM, con valores significativos del valor de p yr2. El DL está representado en los cromosomas IV, V, VIII y IX no dejando de lado el cromosoma I donde la distancia  es de 4 cM con un valor de r2=0.7 .  Además cabe resaltar que se encontró un LD mayor a 0.7 y menor a 0.1 de r2 en los cromosomas II y IV.

No se encontró ninguna asociación entre los valores fenotípicos en la acumulación de carotenoides y los genes candidatos para PSY, BCH, LYC y ZEA, sin embargo cuando se trató de hacer una asociación con marcadores microsatélites estos dieron un resultado positivo con STG0016, STM2022, STI0024, STM1053, STM5140 y STI0023.